为解决九孔（鲍鱼）苗落板及养殖九孔大量死亡问题，台湾水产试验所利用该所建立的九孔分子标志生物技术，辅导业者筛选亲缘较远的养殖九孔或野生九孔，进行远缘杂交育种，已显著改善种苗及种贝品质，经过5年连续追踪结果，育成之幼苗或成贝，成长与活成率均佳，成效显著，大幅改善九孔产业问题。
台湾水产试验所根据多年的现场调查发现，九孔苗齿舌发育不全的比例异常增加，族群成熟体型变小，早熟个体比例上升，遇有水温变动的刺激容易排精排卵，导致大量死亡。这种早熟现象是近亲繁殖的典型结果。该所利用分子标志分析九孔遗传变异，进一步证实养殖九孔族群的基因歧异度远低于野生九孔族群，因即判定基因歧异度低和幼苗落板大量死亡有显著关系。
该所因此建议九孔业者，利用远缘杂交的方式，以养殖的雌贝和野生的雄贝配对来繁殖幼苗，增加幼苗的基因歧异度以解决九孔落苗问题。经过5年，历经4个世代持续追踪远缘杂交育苗，于台东、花莲等地养殖结果显示无论在幼苗培育活存率或成贝养殖成功率均大幅提升。
